轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。相對于傳統的芯片雜交平臺,轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針,即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測,提供更精確的數字化信號,更高的檢測通量以及更廣泛的檢測范圍,是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具?;诟咄繙y序平臺的轉錄組測序技術能夠全面獲得物種特定組織或器官的轉錄本信息,從而進行基因表達水平研究、新轉錄本發現研究、轉錄本結構變異研究等。
1. 觀察疾病發生過程中病灶部位內部的基因表達水平變化
2. 在腫瘤研究中,使用RNA-seq技術可以預測潛在的融合基因
3. 新lncRNA預測和已知lncRNA表達水平研究
4. 新物種的轉錄組數據構建和功能研究